Les Macédoniens, avec l’ensemble des nations de Yougoslavie ont combattu du côté des forces alliées contre l’envahisseur allemand. Des batailles féroces ravagent les territoires des Balkans avec de fortes pertes humaines. Le territoire de la Macédoine du Vardar compte  25 000 morts. On dénombre : 7 000 juifs, 7 000 macédoniens, 6 000 serbes, 4 000 albanais et 1 000 bulgares. Parmi eux, 2 000 civils, 1 000 collaborateurs, 14 000 partisans et soldats de Yougoslavie et 7 000 disparus dans les camps de concentration. Après la Seconde Guerre Mondiale,  la République socialiste de Macédoine, devient une république  indépendante intégrée à la fédération yougoslave nouvellement créée.